Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHST3Q7LGC8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHST3Q7LGC8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHST3Q7LGC8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms