Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARCQ7LC44 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms