Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP47Q6ZTR5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP47Q6ZTR5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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