Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM43Q6ZSC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RBM43Q6ZSC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM43Q6ZSC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms