Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2EQ6VUC0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2EQ6VUC0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2EQ6VUC0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFAP2EQ6VUC0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAP2EQ6VUC0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAP2EQ6VUC0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAP2EQ6VUC0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFAP2EQ6VUC0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TFAP2EQ6VUC0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TFAP2EQ6VUC0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms