Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms