Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA5Q6Q788 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA5Q6Q788 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.57■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.55■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.55■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.54■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
APOA5Q6Q788 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms