Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC27A1Q6PCB7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC27A1Q6PCB7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A1Q6PCB7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A1Q6PCB7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A1Q6PCB7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A1Q6PCB7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A1Q6PCB7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A1Q6PCB7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A1Q6PCB7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A1Q6PCB7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A1Q6PCB7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms