Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF549Q6P9A3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF549Q6P9A3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms