Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD2Q6NTF9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD2Q6NTF9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms