Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIST2H2AA3Q6FI13 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST2H2AA3Q6FI13 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST2H2AA3Q6FI13 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms