Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF13Q5VWM6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF13Q5VWM6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF13Q5VWM6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms