Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF38BQ5VTL8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF38BQ5VTL8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38BQ5VTL8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms