Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEF17Q5VTA0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms