Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP350Q5VT06 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP350Q5VT06 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms