Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIF1Q5UIP0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIF1Q5UIP0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIF1Q5UIP0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms