Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN11Q5T124 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN11Q5T124 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN11Q5T124 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms