Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms