Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPECC1Q5M775 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPECC1Q5M775 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPECC1Q5M775 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms