Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPB2Q5JXA9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIRPB2Q5JXA9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms