Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAT3Q53EU6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAT3Q53EU6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GPAT3Q53EU6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms