Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEACAM16Q2WEN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEACAM16Q2WEN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEACAM16Q2WEN9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CEACAM16Q2WEN9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CEACAM16Q2WEN9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms