Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKIDA1Q1XH10 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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