Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FOXD1Q16676 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FOXD1Q16676 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
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