Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCAQ16586 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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