Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA6Q15825 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms