Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A5Q15758 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A5Q15758 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A5Q15758 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms