Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TGIF1Q15583 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF1Q15583 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGIF1Q15583 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms