Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOFQ13790 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOFQ13790 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOFQ13790 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOFQ13790 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOFQ13790 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOFQ13790 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOFQ13790 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOFQ13790 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOFQ13790 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOFQ13790 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOFQ13790 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOFQ13790 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOFQ13790 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOFQ13790 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOFQ13790 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOFQ13790 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOFQ13790 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOFQ13790 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOFQ13790 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOFQ13790 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOFQ13790 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOFQ13790 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOFQ13790 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOFQ13790 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOFQ13790 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOFQ13790 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOFQ13790 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOFQ13790 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOFQ13790 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOFQ13790 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOFQ13790 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOFQ13790 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOFQ13790 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOFQ13790 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOFQ13790 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOFQ13790 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOFQ13790 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOFQ13790 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOFQ13790 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOFQ13790 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOFQ13790 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOFQ13790 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOFQ13790 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOFQ13790 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOFQ13790 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOFQ13790 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOFQ13790 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOFQ13790 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOFQ13790 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOFQ13790 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOFQ13790 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOFQ13790 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOFQ13790 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOFQ13790 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOFQ13790 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOFQ13790 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOFQ13790 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOFQ13790 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOFQ13790 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOFQ13790 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOFQ13790 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOFQ13790 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOFQ13790 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOFQ13790 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOFQ13790 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOFQ13790 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOFQ13790 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOFQ13790 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOFQ13790 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOFQ13790 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOFQ13790 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOFQ13790 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOFQ13790 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOFQ13790 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOFQ13790 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOFQ13790 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOFQ13790 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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