Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SF3B2Q13435 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B2Q13435 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SF3B2Q13435 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SF3B2Q13435 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms