Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DUSP4Q13115 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUSP4Q13115 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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