Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXF1Q12946 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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FOXF1Q12946 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF1Q12946 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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