Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 MET7YOR241W 1647 nt5.24□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 OSW2YLR054C 2175 nt5.24□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 RAD59YDL059C 717 nt5.24□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 RAM1YDL090C 1296 nt5.24□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 MRS3YJL133W 945 nt5.24□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 PML1YLR016C 615 nt5.24□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.24□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 COA2YPL189C-A 207 nt5.24□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 RPN7YPR108W 1290 nt5.24□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 YFL042CYFL042C 2025 nt5.24□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 MTC5YDR128W 3447 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 PYC1YGL062W 3537 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 VMA4YOR332W 702 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 REG2YBR050C 1017 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 GUD1YDL238C 1470 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 VRP1YLR337C 2454 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 PIF1YML061C 2580 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 NSI1YDR026C 1713 nt5.23□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 OXP1YKL215C 3861 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 VNX1YNL321W 2727 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 LPL1YOR059C 1353 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 MPC2YHR162W 390 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 VTH1YIL173W 4650 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 VTH2YJL222W 4650 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 DRE2YKR071C 1047 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 GLC8YMR311C 690 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 NRM1YNR009W 750 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 WHI4YDL224C 1950 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 WTM1YOR230W 1314 nt5.22□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 ABZ1YNR033W 2364 nt5.21□□□□□ -1.57
VAM3Q12241 ARH1YDR376W 1482 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 WHI2YOR043W 1461 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 YCR006CYCR006C 474 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 HST4YDR191W 1113 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 TDH2YJR009C 999 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 NPA3YJR072C 1158 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 YJR115WYJR115W 510 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 AAT2YLR027C 1257 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 HMT1YBR034C 1047 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 snR32snR32 188 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 MAL11YGR289C 1851 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 YPR196WYPR196W 1413 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 HST3YOR025W 1344 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 KKQ8YKL168C 2175 nt5.21□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 BUD14YAR014C 2130 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 SDH4YDR178W 546 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 SPC42YKL042W 1092 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 MDH1YKL085W 1005 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 RPL10YLR075W 666 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 PDR16YNL231C 1056 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 MRPS12YNR036C 462 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 YNR040WYNR040W 771 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 YOL079WYOL079W 399 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 YPL136WYPL136W 369 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 CRF1YDR223W 1404 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 RVB2YPL235W 1416 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 SPC97YHR172W 2472 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 TAX4YJL083W 1815 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 FRE7YOL152W 1863 nt5.2□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 GPA2YER020W 1350 nt5.19□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 YPL245WYPL245W 1365 nt5.19□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 FRS2YFL022C 1512 nt5.19□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 PHM8YER037W 966 nt5.19□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 MSP1YGR028W 1089 nt5.19□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 VPS24YKL041W 675 nt5.19□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 SRN2YLR119W 642 nt5.19□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 ADD37YMR184W 597 nt5.19□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 PPR1YLR014C 2715 nt5.19□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 KEX2YNL238W 2445 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 CTS2YDR371W 1536 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 GAT1YFL021W 1533 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 FHL1YPR104C 2811 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 ASP1YDR321W 1146 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 RPN11YFR004W 921 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 PHO86YJL117W 936 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 TSA1YML028W 591 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 RRS1YOR294W 612 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 ACS2YLR153C 2052 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 AMA1YGR225W 1782 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 TUL1YKL034W 2277 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 PTK2YJR059W 2457 nt5.18□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 COR1YBL045C 1374 nt5.17□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 CLB1YGR108W 1416 nt5.17□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 RRP1YDR087C 837 nt5.17□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 OSW5YMR148W 447 nt5.17□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 RPC19YNL113W 429 nt5.17□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 YDR132CYDR132C 1488 nt5.17□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 CLP1YOR250C 1338 nt5.17□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 ALD6YPL061W 1503 nt5.17□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 NTH2YBR001C 2343 nt5.17□□□□□ -1.58
VAM3Q12241 DBP9YLR276C 1785 nt5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms