Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 PGK1YCR012W 1251 nt5.76□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 SIT4YDL047W 936 nt5.76□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 LCP5YER127W 1074 nt5.76□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 YHR140WYHR140W 720 nt5.76□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.76□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 VMA4YOR332W 702 nt5.76□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 SGF29YCL010C 780 nt5.76□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 YCK1YHR135C 1617 nt5.76□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 URA7YBL039C 1740 nt5.76□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 GIT1YCR098C 1557 nt5.76□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.75□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 GLC8YMR311C 690 nt5.75□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 NPT1YOR209C 1290 nt5.75□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 DFG5YMR238W 1377 nt5.75□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 UIP5YKR044W 1332 nt5.74□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 SDH4YDR178W 546 nt5.74□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 CTR2YHR175W 570 nt5.74□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 YJR084WYJR084W 1272 nt5.74□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 YKL107WYKL107W 930 nt5.74□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 NOC4YPR144C 1659 nt5.73□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 PEX7YDR142C 1128 nt5.73□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 CHO1YER026C 831 nt5.73□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 PDE1YGL248W 1110 nt5.73□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 HAL1YPR005C 885 nt5.73□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 RCK1YGL158W 1539 nt5.73□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 NTE1YML059C 5040 nt5.73□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 ADE13YLR359W 1449 nt5.73□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 TEP1YNL128W 1305 nt5.73□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 UTP18YJL069C 1785 nt5.72□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 PDC1YLR044C 1692 nt5.72□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 TUP1YCR084C 2142 nt5.72□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 GUD1YDL238C 1470 nt5.72□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 TUL1YKL034W 2277 nt5.72□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 RAD59YDL059C 717 nt5.72□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 YOL163WYOL163W 510 nt5.72□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 YPL062WYPL062W 405 nt5.72□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 RPT2YDL007W 1314 nt5.72□□□□□ -1.49
NFI1Q12216 SIA1YOR137C 1869 nt5.71□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 MNN5YJL186W 1761 nt5.71□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 MPP10YJR002W 1782 nt5.71□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 ASH1YKL185W 1767 nt5.71□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 RPT3YDR394W 1287 nt5.71□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.71□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YFR035CYFR035C 345 nt5.71□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 PTR2YKR093W 1806 nt5.71□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 GUA1YMR217W 1578 nt5.71□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 COR1YBL045C 1374 nt5.7□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 PHO90YJL198W 2646 nt5.7□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YDR053WYDR053W 396 nt5.7□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 IPK1YDR315C 846 nt5.7□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 ECT1YGR007W 972 nt5.7□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 GLN1YPR035W 1113 nt5.7□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YIL067CYIL067C 2037 nt5.7□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 NUD1YOR373W 2556 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 WTM2YOR229W 1404 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 CDC10YCR002C 969 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 IMG1YCR046C 510 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 SRG1SRG1 551 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 RPL12AYEL054C 498 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 CUP2YGL166W 678 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 ERP5YHR110W 639 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 ECM14YHR132C 1293 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 WHI2YOR043W 1461 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 GRS1YBR121C 2004 nt5.69□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YDL121CYDL121C 450 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YDR187CYDR187C 519 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 MPC2YHR162W 390 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 AAT2YLR027C 1257 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YOL131WYOL131W 327 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 RRS1YOR294W 612 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 HOF1YMR032W 2010 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 AFT1YGL071W 2073 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YTA6YPL074W 2265 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 ATH1YPR026W 3636 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 NRD1YNL251C 1728 nt5.68□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 ARN2YHL047C 1863 nt5.67□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 AI5_BETAQ0075 1065 nt5.67□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 BCY1YIL033C 1251 nt5.67□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.67□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.67□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 ADE6YGR061C 4077 nt5.67□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 KKQ8YKL168C 2175 nt5.67□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 HST3YOR025W 1344 nt5.67□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 RVB2YPL235W 1416 nt5.66□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 VMA13YPR036W 1437 nt5.66□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 TOS3YGL179C 1683 nt5.66□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 KRE9YJL174W 831 nt5.66□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YNL228WYNL228W 777 nt5.66□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 IFA38YBR159W 1044 nt5.66□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 SRV2YNL138W 1581 nt5.66□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YPR196WYPR196W 1413 nt5.65□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 CAX4YGR036C 720 nt5.65□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.65□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.65□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.65□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.65□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.65□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.65□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 RPE1YJL121C 717 nt5.65□□□□□ -1.5
NFI1Q12216 YBL112CYBL112C 318 nt5.65□□□□□ -1.5
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