Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 YNL247WYNL247W 2304 nt6.51□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 CDC23YHR166C 1881 nt6.5□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YJU2YKL095W 837 nt6.5□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 SRY1YKL218C 981 nt6.5□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 HRT3YLR097C 1035 nt6.5□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YOR097CYOR097C 528 nt6.5□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 GEX1YCL073C 1848 nt6.5□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 GEX2YKR106W 1848 nt6.5□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 GUP2YPL189W 1830 nt6.5□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 SRP101YDR292C 1866 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YKL147CYKL147C 618 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 MTF1YMR228W 1026 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YNL217WYNL217W 981 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 TLG2YOL018C 1194 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 LIP5YOR196C 1245 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YPR153WYPR153W 423 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YBR124WYBR124W 360 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 AFG1YEL052W 1530 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 RIT1YMR283C 1542 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 SSK1YLR006C 2139 nt6.49□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 TIM22YDL217C 624 nt6.48□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 NCS6YGL211W 1080 nt6.48□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YGR273CYGR273C 525 nt6.48□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YJL032WYJL032W 315 nt6.48□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 TOM40YMR203W 1164 nt6.48□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YPL191CYPL191C 1083 nt6.48□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YOL036WYOL036W 2286 nt6.48□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 SSU1YPL092W 1377 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 UME1YPL139C 1383 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YLR345WYLR345W 1530 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 HAS1YMR290C 1518 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YDR220CYDR220C 294 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 PET117YER058W 324 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 SFK1YKL051W 1062 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 YLR407WYLR407W 687 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 URA5YML106W 681 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 KTR5YNL029C 1569 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 RDR1YOR380W 1641 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 CLN2YPL256C 1638 nt6.47□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 EFM1YHL039W 1758 nt6.46□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 LSG1YGL099W 1923 nt6.46□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 IME2YJL106W 1938 nt6.46□□□□□ -1.37
AVO1Q08236 PUP2YGR253C 783 nt6.46□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 POL32YJR043C 1053 nt6.46□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 VMA6YLR447C 1038 nt6.46□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 PTH2YBL057C 627 nt6.46□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YPL067CYPL067C 597 nt6.46□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 KIN1YDR122W 3195 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 snR63snR63 255 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 BTT1YDR252W 450 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 KXD1YGL079W 657 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YGL262WYGL262W 528 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 TAP42YMR028W 1101 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 ATG16YMR159C 453 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 CKB2YOR039W 777 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 MRP51YPL118W 1035 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 SMK1YPR054W 1167 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 SDH8YBR269C 417 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 APA1YCL050C 966 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 APM3YBR288C 1452 nt6.45□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 ERG7YHR072W 2196 nt6.44□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 TRR2YHR106W 1029 nt6.44□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.44□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 KRE9YJL174W 831 nt6.44□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 CPR8YNR028W 927 nt6.44□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 PSH1YOL054W 1221 nt6.44□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 REX4YOL080C 870 nt6.44□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 CDC7YDL017W 1524 nt6.44□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 CAN1YEL063C 1773 nt6.44□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 RNR3YIL066C 2610 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YPQ2YDR352W 954 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 EBP2YKL172W 1284 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 ECM1YAL059W 639 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YMR245WYMR245W 621 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YPQ1YOL092W 927 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 IZH4YOL101C 939 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 IPP1YBR011C 864 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 SKI2YLR398C 3864 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 AVO1YOL078W 3531 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 DDC1YPL194W 1839 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 MFG1YDL233W 1377 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 AIM17YHL021C 1398 nt6.43□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YHL012WYHL012W 1482 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 NFS1YCL017C 1494 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 FLC2YAL053W 2352 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 UPS3YDR185C 540 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 TRS23YDR246W 660 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YDR282CYDR282C 1245 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YFL019CYFL019C 354 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 MOB2YFL034C-B 864 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 CYS3YAL012W 1185 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YML101C-AYML101C-A 318 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 RPR1RPR1 369 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 PRS4YBL068W 981 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 BSC4YNL269W 396 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 YNR025CYNR025C 360 nt6.42□□□□□ -1.38
AVO1Q08236 MRPL23YOR150W 492 nt6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.4 ms