Protein–RNA interactions for Protein: Q08235

BRX1, Ribosome biogenesis protein BRX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1Q08235 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 GCV3YAL044C 513 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 ADE13YLR359W 1449 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 YNR040WYNR040W 771 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 PSE1YMR308C 3270 nt5.43□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SKS1YPL026C 1509 nt5.43□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 WTM2YOR229W 1404 nt5.43□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 LEU5YHR002W 1074 nt5.43□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 MOG1YJR074W 657 nt5.43□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 ZRT2YLR130C 1269 nt5.43□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 AFT1YGL071W 2073 nt5.43□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 MCM3YEL032W 2916 nt5.42□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 OCA5YHL029C 2040 nt5.42□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 RPN11YFR004W 921 nt5.42□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 RPT6YGL048C 1218 nt5.42□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 YKL107WYKL107W 930 nt5.42□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 KCH1YJR054W 1494 nt5.42□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 NUD1YOR373W 2556 nt5.41□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 RPE1YJL121C 717 nt5.41□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 RPN7YPR108W 1290 nt5.41□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 PMT2YAL023C 2280 nt5.41□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 TUP1YCR084C 2142 nt5.41□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 ISN1YOR155C 1353 nt5.41□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 VMA13YPR036W 1437 nt5.4□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SPC97YHR172W 2472 nt5.4□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 URA3YEL021W 804 nt5.4□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 PHB1YGR132C 864 nt5.4□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 PRE3YJL001W 648 nt5.4□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 GSY2YLR258W 2118 nt5.4□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 CIN4YMR138W 576 nt5.4□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 VPS4YPR173C 1314 nt5.4□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 YIL067CYIL067C 2037 nt5.4□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 SNF3YDL194W 2655 nt5.39□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 RAD3YER171W 2337 nt5.39□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.39□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.39□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.39□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 YKR073CYKR073C 321 nt5.39□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 MDY2YOL111C 639 nt5.39□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 HST2YPL015C 1074 nt5.39□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 PEX19YDL065C 1029 nt5.38□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 YJU3YKL094W 942 nt5.38□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 ADE12YNL220W 1302 nt5.38□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 PRI2YKL045W 1587 nt5.38□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 STE20YHL007C 2820 nt5.37□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 SIT4YDL047W 936 nt5.37□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 HAP2YGL237C 798 nt5.37□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 SIP5YMR140W 1470 nt5.37□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 UBX2YML013W 1755 nt5.37□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 EPS1YIL005W 2106 nt5.36□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 VMA4YOR332W 702 nt5.36□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 MRPS5YBR251W 924 nt5.36□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 VTC2YFL004W 2487 nt5.35□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 GAT1YFL021W 1533 nt5.35□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 EEB1YPL095C 1371 nt5.35□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 LYS21YDL131W 1323 nt5.35□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 CAX4YGR036C 720 nt5.35□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 RIM101YHL027W 1878 nt5.34□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 GIT1YCR098C 1557 nt5.34□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 RME1YGR044C 903 nt5.34□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 DOM34YNL001W 1161 nt5.34□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 UBC11YOR339C 471 nt5.34□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 ENV7YPL236C 1095 nt5.34□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 YPK2YMR104C 2034 nt5.34□□□□□ -1.55
BRX1Q08235 KEX2YNL238W 2445 nt5.34□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 PXA1YPL147W 2613 nt5.33□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 DJP1YIR004W 1299 nt5.33□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 RPL10YLR075W 666 nt5.33□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 TAL1YLR354C 1008 nt5.33□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.33□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 HSP78YDR258C 2436 nt5.32□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 YER186CYER186C 921 nt5.32□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 RPL7AYGL076C 735 nt5.32□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 RPS2YGL123W 765 nt5.32□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 RPL7BYPL198W 735 nt5.32□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 APE3YBR286W 1614 nt5.32□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 YDR109CYDR109C 2148 nt5.32□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 ATH1YPR026W 3636 nt5.31□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 MNS1YJR131W 1650 nt5.31□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 SEC9YGR009C 1956 nt5.31□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 DPH2YKL191W 1605 nt5.31□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.31□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 ECM19YLR390W 339 nt5.31□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 PEX32YBR168W 1242 nt5.31□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 DIA3YDL024C 1407 nt5.31□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 ECT1YGR007W 972 nt5.3□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 LYS12YIL094C 1116 nt5.3□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 YBR144CYBR144C 315 nt5.3□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 PKC1YBL105C 3456 nt5.3□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 COR1YBL045C 1374 nt5.29□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 MKC7YDR144C 1791 nt5.29□□□□□ -1.56
BRX1Q08235 TOS3YGL179C 1683 nt5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms