Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms