Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF4Q08170 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF4Q08170 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms