Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR3Q06889 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR3Q06889 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms