Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KDSRQ06136 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms