Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GBE1Q04446 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBE1Q04446 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms