Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 RGT1YKL038W 3513 nt5.94□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 ILV1YER086W 1731 nt5.94□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.93□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.93□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 BUG1YDL099W 1026 nt5.93□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 YDR396WYDR396W 501 nt5.93□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 RPS3YNL178W 723 nt5.93□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 AMD2YDR242W 1650 nt5.93□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 RFA1YAR007C 1866 nt5.93□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 PPR1YLR014C 2715 nt5.93□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 RNR3YIL066C 2610 nt5.93□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 MAL11YGR289C 1851 nt5.92□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 IPK1YDR315C 846 nt5.92□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 MRS3YJL133W 945 nt5.92□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 PFA3YNL326C 1011 nt5.92□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 RPN5YDL147W 1338 nt5.92□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 YME1YPR024W 2244 nt5.91□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 AIM20YIL158W 615 nt5.91□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 YJR084WYJR084W 1272 nt5.91□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 FPR3YML074C 1236 nt5.91□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 MTF1YMR228W 1026 nt5.91□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 HEM15YOR176W 1182 nt5.91□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 ERI1YPL096C-A 207 nt5.91□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 YPR150WYPR150W 522 nt5.91□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 UIP5YKR044W 1332 nt5.91□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 YEH1YLL012W 1722 nt5.91□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 UBX2YML013W 1755 nt5.9□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 FLC3YGL139W 2409 nt5.9□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 ENT2YLR206W 1842 nt5.9□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 UGO1YDR470C 1509 nt5.9□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 FRS2YFL022C 1512 nt5.9□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 ZWF1YNL241C 1518 nt5.9□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 NHA1YLR138W 2958 nt5.9□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 SRY1YKL218C 981 nt5.9□□□□□ -1.46
YKU80Q04437 WHI4YDL224C 1950 nt5.89□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 KKQ8YKL168C 2175 nt5.89□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 MNN2YBR015C 1794 nt5.89□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YKL153WYKL153W 510 nt5.89□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 COA2YPL189C-A 207 nt5.89□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 SGF29YCL010C 780 nt5.89□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 RAD3YER171W 2337 nt5.89□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YBR138CYBR138C 1575 nt5.89□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 RAM1YDL090C 1296 nt5.88□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 SNZ3YFL059W 897 nt5.88□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 SNZ2YNL333W 897 nt5.88□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 GPI18YBR004C 1302 nt5.88□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 LPL1YOR059C 1353 nt5.88□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 MMR1YLR190W 1476 nt5.88□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 ALT1YLR089C 1779 nt5.88□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 OXP1YKL215C 3861 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 RAD59YDL059C 717 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 COX20YDR231C 618 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 CUP2YGL166W 678 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 BCY1YIL033C 1251 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YIR043CYIR043C 693 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 AAT2YLR027C 1257 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 SCS22YBL091C-A 528 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YNR040WYNR040W 771 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YBL112CYBL112C 318 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 CLP1YOR250C 1338 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 COR1YBL045C 1374 nt5.87□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 ATG1YGL180W 2694 nt5.86□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 PMP3YDR276C 168 nt5.86□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 VAM7YGL212W 951 nt5.86□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 PML1YLR016C 615 nt5.86□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 ADD37YMR184W 597 nt5.86□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YMR252CYMR252C 405 nt5.86□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 GLC8YMR311C 690 nt5.86□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 MTQ1YNL063W 945 nt5.86□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 VRP1YLR337C 2454 nt5.86□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 HSP78YDR258C 2436 nt5.86□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 FRE7YOL152W 1863 nt5.85□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 ABZ1YNR033W 2364 nt5.85□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 RRS1YOR294W 612 nt5.85□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 SMF2YHR050W 1650 nt5.85□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 PKC1YBL105C 3456 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 ISN1YOR155C 1353 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YDR053WYDR053W 396 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 SDH4YDR178W 546 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YDR187CYDR187C 519 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 SIP2YGL208W 1248 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YKL107WYKL107W 930 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 PRT1YOR361C 2292 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 PDC1YLR044C 1692 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 ATR1YML116W 1629 nt5.84□□□□□ -1.47
YKU80Q04437 ASF2YDL197C 1578 nt5.84□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 CTS2YDR371W 1536 nt5.84□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 MPP10YJR002W 1782 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 ERC1YHR032W 1746 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 HST3YOR025W 1344 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 WTM1YOR230W 1314 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YDL057WYDL057W 987 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YGR176WYGR176W 348 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64.8 ms