Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	YKR041W	YKR041W	753 nt		4.68	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	YOR111W	YOR111W	699 nt		4.68	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	Q0010	Q0010	387 nt		4.68	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	ADE12	YNL220W	1302 nt		4.68	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	RPT4	YOR259C	1314 nt		4.68	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	PIF1	YML061C	2580 nt		4.67	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	MDH3	YDL078C	1032 nt		4.67	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	YDR396W	YDR396W	501 nt		4.67	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	SSZ1	YHR064C	1617 nt		4.67	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	MSN2	YMR037C	2115 nt		4.67	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	YOR1	YGR281W	4434 nt		4.66	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	ERG7	YHR072W	2196 nt		4.66	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	OPI7	YDR360W	435 nt		4.66	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	YJL193W	YJL193W	1209 nt		4.66	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	YNL108C	YNL108C	813 nt		4.66	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	CSG2	YBR036C	1233 nt		4.66	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	SKS1	YPL026C	1509 nt		4.66	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	HFI1	YPL254W	1467 nt		4.65	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	YEA6	YEL006W	1008 nt		4.65	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	RNH201	YNL072W	924 nt		4.65	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	RAT1	YOR048C	3021 nt		4.65	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	ISN1	YOR155C	1353 nt		4.65	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	SMF3	YLR034C	1422 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	YDL114W	YDL114W	927 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	SOH1	YGL127C	384 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	BUD32	YGR262C	786 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	DOT5	YIL010W	648 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	MDH1	YKL085W	1005 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	YBL044W	YBL044W	369 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	MTQ1	YNL063W	945 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	PRP46	YPL151C	1356 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	TEF1	YPR080W	1377 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	TEF2	YBR118W	1377 nt		4.64	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	HXT3	YDR345C	1704 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	PRS1	YKL181W	1284 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	YML018C	YML018C	1182 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	BUD9	YGR041W	1644 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	UTP7	YER082C	1665 nt		4.63	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	MTQ2	YDR140W	666 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	NQM1	YGR043C	1002 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	NRD1	YNL251C	1728 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	RPT2	YDL007W	1314 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	TRK2	YKR050W	2670 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	TAX4	YJL083W	1815 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	CHL4	YDR254W	1377 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	ACF2	YLR144C	2340 nt		4.62	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	VPS1	YKR001C	2115 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	FOL1	YNL256W	2475 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	MRF1	YGL143C	1242 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	snR32	snR32	188 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	UGO1	YDR470C	1509 nt		4.61	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	UBX2	YML013W	1755 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	MAL11	YGR289C	1851 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	YCL065W	YCL065W	369 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	YDR541C	YDR541C	1035 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	CDC11	YJR076C	1248 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	AAD15	YOL165C	432 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	DNF2	YDR093W	4839 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	TAH18	YPR048W	1872 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	VHS1	YDR247W	1386 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	PMP3	YDR276C	168 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	RML2	YEL050C	1182 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	ATE1	YGL017W	1512 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	VMA16	YHR026W	642 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	RRP4	YHR069C	1080 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	SSY5	YJL156C	2100 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	YPL136W	YPL136W	369 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YMR090W	Q04304	JIP4	YDR475C	2631 nt		4.59	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	GCS1	YDL226C	1059 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	TRP1	YDR007W	675 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	YRA1	YDR381W	681 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	YEL075W-A	YEL075W-A	612 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	YLR463C	YLR463C	552 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	YNL097W-A	YNL097W-A	156 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	GUF1	YLR289W	1938 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	GAA1	YLR088W	1845 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	YFL034W	YFL034W	3222 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	MPM1	YJL066C	759 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	MTW1	YAL034W-A	870 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	YLR157W-E	YLR157W-E	165 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	BRF1	YGR246C	1791 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	COR1	YBL045C	1374 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	NRM1	YNR009W	750 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	CAM1	YPL048W	1248 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	ATG12	YBR217W	561 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	HRP1	YOL123W	1605 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	SNU71	YGR013W	1863 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	FRE3	YOR381W	2136 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	YFL052W	YFL052W	1398 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	YDL022C-A	YDL022C-A	249 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	PHO86	YJL117W	936 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	APN1	YKL114C	1104 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	STE50	YCL032W	1041 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	BUD14	YAR014C	2130 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	DPH2	YKL191W	1605 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	VAM7	YGL212W	951 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	YGR176W	YGR176W	348 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YMR090W	Q04304	MND2	YIR025W	1107 nt		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.7 ms