Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RELAQ04206 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RELAQ04206 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RELAQ04206 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RELAQ04206 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RELAQ04206 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RELAQ04206 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RELAQ04206 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RELAQ04206 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RELAQ04206 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RELAQ04206 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RELAQ04206 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RELAQ04206 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RELAQ04206 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RELAQ04206 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RELAQ04206 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELAQ04206 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELAQ04206 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELAQ04206 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELAQ04206 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELAQ04206 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELAQ04206 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELAQ04206 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RELAQ04206 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELAQ04206 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELAQ04206 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELAQ04206 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELAQ04206 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELAQ04206 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELAQ04206 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELAQ04206 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELAQ04206 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELAQ04206 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELAQ04206 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELAQ04206 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELAQ04206 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELAQ04206 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RELAQ04206 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELAQ04206 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELAQ04206 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELAQ04206 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELAQ04206 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELAQ04206 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELAQ04206 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RELAQ04206 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RELAQ04206 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RELAQ04206 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RELAQ04206 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RELAQ04206 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RELAQ04206 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RELAQ04206 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RELAQ04206 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RELAQ04206 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RELAQ04206 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RELAQ04206 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RELAQ04206 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RELAQ04206 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELAQ04206 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELAQ04206 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELAQ04206 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELAQ04206 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELAQ04206 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELAQ04206 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELAQ04206 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RELAQ04206 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RELAQ04206 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RELAQ04206 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RELAQ04206 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RELAQ04206 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RELAQ04206 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RELAQ04206 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RELAQ04206 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELAQ04206 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELAQ04206 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELAQ04206 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELAQ04206 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELAQ04206 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RELAQ04206 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELAQ04206 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELAQ04206 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELAQ04206 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELAQ04206 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RELAQ04206 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RELAQ04206 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RELAQ04206 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RELAQ04206 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RELAQ04206 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RELAQ04206 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RELAQ04206 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RELAQ04206 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms