Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB2Q03252 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms