Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPCQ03188 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPCQ03188 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms