Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFITM3Q01628 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IFITM3Q01628 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms