Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1BQ00975 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms