Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL1Q00532 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms