Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC1P78348 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ASIC1P78348 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms